1、改编一：武媚娘身怀李世民遗腹子
史实：武媚娘从未怀过李世民孩子，反而在李世民病重时与太子私通
历史上武媚娘从未怀过李世民孩子，这个孩子本来就是李治的。总局认为这一改编违背历史，所以只能靠配音和剪辑改成李治的孩子，所以才会出现跟李治抱抱就怀孕的奇葩剧情。
2、改编二：徐慧由善到恶性情大变，不受宠爱沦为奸妃
史实：徐慧贤良淑德，深受李世民宠爱
隋朝将军，二婚唐太宗，生有一子一女，善终。
唐代最重要的士族家族之一。韦妃名列“四夫人”（正一品）之首，多次陷害妃子皇嗣。然而历史中韦贵妃出身京兆韦氏，隋唐之际著名士族家族之一，家世显赫。她第一个丈夫是出身渤海李氏、隋朝大将军、户部尚书李子雄的儿子李珉。613年（隋大业九年），李子雄随杨玄感起兵谋反，兵败后李子雄父子均被杀。621年左右，李世民迎娶韦氏姐妹，韦珪深得太宗宠爱，但是其本人却从未因此骄纵，反而恭谦有加。665年（唐高宗麟德二年），韦珪和越国太妃燕氏陪同高宗到泰山封禅，病逝于河南敦行里第，享年69岁。
9、改编九：高阳公主杀死武媚娘孩子
史实：1、武媚娘自己杀死 2、孩子因体弱夭折
《武媚娘传奇》中，武媚娘的孩子是高阳公主害死的。而历史上，有两种说法，一种是武媚娘掐死自己孩子嫁祸王皇后，然后自己当了皇后，王皇后被贬为平民了。还有一种说法，是孩子天生体弱而夭折。
10、改编十：齐王李佑谋反李世民饶恕，李佑被舅舅殷大人杀死
史实：李佑是被李世民赐死的。
剧中齐王李佑被舅舅殷氏家族蛊惑谋反，还牵连到母亲德妃被杀。李世民命令找到李佑，不得伤害他。但是历史上贞观十七年第五子齐王李祐在齐州起兵谋反，唐太宗李世民愤然提笔写下了一道谴责李祐的手诏。公元643年被唐太宗赐死于内省，贬为庶人。