邱会高，1922年7月出生，江苏省江阴县人。又名邱巍高。1939年加入中国共产党，1941年参加新四军。
1938年，邱会高参加革命。
战争年代，邱会高历任班长、排长、干事、副连长、连指导员、作战参谋、营副教导员、副营长、营教导员、营长、区队参谋长、雁北指挥部6团副团长兼参谋长、冀中军区第8军分区66团团长、华北军区第3纵队9旅团长、旅代参谋长、第63军189师副师长兼参谋长、军司令部参谋处处长、第63军187师副师长。
新中国成立后，邱会高任第63军187师代师长、师长、189师师长、第63军副军长兼参谋长。
1968年9月，邱会高任北京卫戍区副参谋长。
1971年5月，邱会高任北京卫戍区副司令员兼参谋长。
1975年9月-1985年7月，邱会高任北京卫戍区副司令员。
邱会高955年9月被授予大校军衔，荣获三级独立自由勋章、三级解放勋章、独立功勋荣誉章。
2011年1月4日，邱会高因病在北京逝世，享年89岁。